真菌性關節炎又稱霉菌性關節炎。真菌感染所致肌肉骨骼病變罕見，但致病性和機遇性真菌感染的發生以及新種真菌感染的出現則在增多，特別是免疫抑制病人。慢性演變和診斷遲延都是常有的事。真菌是慢性肉芽腫性關節炎的常見致病因子。各種真菌都可以引起骨關節病變。侵害筋骨系統的最常見真菌是粗球孢子菌(Coccidioideimmitis)、莢膜組織胞漿菌(Histoplasmacapsulatum)、皮炎芽生菌(Blastomycetesdermatitis)、申氏孢子絲菌(Sporothrixschenckii)和免疫機能障礙者的念珠菌、曲霉、隱球菌和組織胞漿菌等。
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