清華大學第二附屬醫院（清華大學玉泉醫院）是一所向社會開放的二級甲等綜合性醫院，1983年12月建院，2003年4月10日劃歸清華大學，由著名的神經外科專家左煥琮教授擔任院長。醫院掛牌“醫療保險定點醫院”，具有高級干部醫療保健資質；被評為“愛嬰醫院”，婦產科獲得三級助產機構資質；加入北京市社區服務熱線呼叫系統（96156）；已申報并通過“北京市工傷定點醫院”的資質初審。
醫院占地面積32580平方米，建筑面積52000平方米，近期將投資新建建筑面積19659平方米的醫療綜合樓。醫院現開放病床數331張。擁有西門子1.5T磁共振成像系統、西門子16層螺旋CT、飛利浦血管造影系統等國內外先進的醫療儀器。醫院在職職工697人（含事業編制417人）；其中衛生專業技術人員512人（含高級職稱83人），博士生導師3人，碩士生導師5人；有9位專家享受政府特殊津貼。
醫院主要打造重點學科：神經中心，由著名的神經外科專家，顯微血管減壓術治療三叉神經痛、面肌痙攣國內創始人左煥琮教授掛帥，匯集一批高學歷、臨床經驗豐富的醫師，是清華大學醫學院博士后流動站及博士學位授予點，也是清華大學生命科學與醫學研究院――腦科學與神經疾病研究所的臨床治療中心。神經中心病床數150張，規模居北京地區第3位，自2005年3月至今，完成手術10107例，2010年完成手術2613臺，病人來源覆蓋了除臺灣、澳門及西藏以外的31個省、市、自治區，另有部分蒙古及其他海外患者慕名前來就醫。
神經中心下設功能及微創神經外科、脊髓神經外科、腦癱及周圍神經外科、癲癇研究中心等多個臨床專業組，開展三叉神經痛、面肌痙攣、脊髓疾病、癲癇、腦腫瘤、腦血管疾病、帕金森氏病、腦癱后遺癥等疑難疾病診療。在國內率先采用軟性內鏡治療腦室腦池疾病，多項內鏡下手術填補國內空白，如內鏡下導水管成形或支架植入術、內鏡下后顱窩囊腫造瘺術、內鏡下經導水管第四腦室內囊蟲取出術、第四腦室出口堵塞造瘺術等；在國內首家開展經皮激光椎間盤減壓術，顯微手術治療脊髓拴系綜合征例數最多、療效較好；對腦癱、癲癇病人進行全面系統的診斷和治療；精神衛生科開設臨床心理門診和開放式心理康復病房；疼痛科對皰疹后神經痛、三叉神經痛等多種急慢性和高難度頑固性疼痛的治療效果顯著。
婦產中心在北京市西部地區處于優勢地位，開設普需和特需專家門診及VIP病房，滿足不同醫療需求者，采取醫療與保健相結合的服務模式，提供系統的孕前、孕期、產后一條龍服務。
近年來，醫院重視對臨床醫務人員科研能力的培養，加大對臨床科研的投入力度，逐步提高醫院的整體科研水平。自2004年起，共獲國家自然科學基金立項6個，北京市自然基金項目1人，首都醫學發展科研基金項目9個，與加拿大、日本、香港等開展多個橫向合作研究課題，并得到科技部、清華大學醫學院的科研扶持。
近期醫院與國內外一流學術機構建立了更多的臨床與科研方面的合作關系：與日本腦神經外科學會、北海道大學及多家機構等合作組建腦血管病研究協作組和放射治療中心；與加拿大麥吉爾（MaGill）大學和日本靜岡癲癇神經中心合作，培養我院青年醫師和促進神經外科專業的發展。
今后醫院將繼續突出神經科學、婦產科學的專業特色，提高和強化國內外學術地位和影響力，并在此基礎上扶持腫瘤消融、口腔科、手外科等優勢專科特色，同時兼顧內科、外科等其他綜合科室發展。積極打造清華大學玉泉醫院品牌，發展成為具有清華特色，集教學、科研和臨床醫療于一體的“大專科、小綜合”型的現代化教學科研醫院，成為清華醫學發展的臨床基地。